Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms