Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms