Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX10Q9Y5X0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX10Q9Y5X0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX10Q9Y5X0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX10Q9Y5X0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX10Q9Y5X0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX10Q9Y5X0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX10Q9Y5X0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX10Q9Y5X0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX10Q9Y5X0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX10Q9Y5X0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms