Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4BQ9Y4P1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms