Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms