Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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