Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSEQ9UL01 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms