Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5BQ9UGL1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms