Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP36Q9P275 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms