Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD5Q9P267 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD5Q9P267 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms