Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP4Q9P0V3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP4Q9P0V3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP4Q9P0V3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP4Q9P0V3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP4Q9P0V3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SH3BP4Q9P0V3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SH3BP4Q9P0V3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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