Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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