Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP4Q9H6H4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms