Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CIPCQ9C0C6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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