Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms