Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TINF2Q9BSI4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms