Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNS3Q9BQ31 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNS3Q9BQ31 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms