Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms