Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PKP4Q99569 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PKP4Q99569 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PKP4Q99569 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PKP4Q99569 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PKP4Q99569 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PKP4Q99569 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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