Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME1Q96AY2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms