Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHIPQ8WWQ0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms