Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP43Q70EL4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP43Q70EL4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP43Q70EL4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP43Q70EL4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP43Q70EL4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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USP43Q70EL4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP43Q70EL4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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