Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP3Q6NUK4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms