Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF220Q5VTB9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms