Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC38Q5VT99 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms