Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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CCDC96Q2M329 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CCDC96Q2M329 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CCDC96Q2M329 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CCDC96Q2M329 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CCDC96Q2M329 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CCDC96Q2M329 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CCDC96Q2M329 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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