Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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