Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NPTX1Q15818 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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