Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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