Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CDSNQ15517 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CDSNQ15517 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CDSNQ15517 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CDSNQ15517 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CDSNQ15517 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDSNQ15517 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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