Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms