Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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