Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NWD1Q149M9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NWD1Q149M9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NWD1Q149M9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NWD1Q149M9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NWD1Q149M9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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NWD1Q149M9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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NWD1Q149M9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NWD1Q149M9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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