Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms