Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC022395.1-201ENST00000451610 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MKRN4PQ13434 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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