Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM28Q13263 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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