Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms