Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms