Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCE1P61221 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms