Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP3P57721 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP3P57721 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP3P57721 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP3P57721 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP3P57721 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP3P57721 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP3P57721 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP3P57721 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP3P57721 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCBP3P57721 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCBP3P57721 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCBP3P57721 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCBP3P57721 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms