Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIRAP54198 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIRAP54198 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIRAP54198 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIRAP54198 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIRAP54198 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIRAP54198 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIRAP54198 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIRAP54198 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIRAP54198 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIRAP54198 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms