Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms