Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCA2P51531 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms