Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms