Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRXP46100 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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