Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms