Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CTSSP25774 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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