Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRCP23327 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HRCP23327 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HRCP23327 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRCP23327 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms