Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA1P20827 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms