Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN1P18031 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms